Với mục tiêu xây dựng Trường liên cấp Fansipan thành mô hình giáo dục hiện đại, phát triển theo chuẩn quốc tế - là ngôi trường mơ ước của phụ huynh và học sinh nên chương trình dạy học của Trường sẽ kết hợp giữa chương trình Chuẩn của Bộ giáo dục Việt Nam với:
Trường TH và THCS Fansipan có Nhà giáo ưu tú Tào Ngọc Thanh làm hiệu trưởng. Đội ngũ giáo viên của Trường gồm giáo viên Việt Nam và giáo viên nước ngoài được tuyển chọn kỹ lưỡng, được các chuyên gia giáo dục hàng đầu của Việt Nam tập huấn bài bản để có thể giảng dạy tốt Chương trình giáo dục đặc biệt của trường, hướng tới mục tiêu và những giá trị cốt lõi mà nhà trường đã lựa chọn.